下面是關于固相萃取儀的常見問題:
　　一、固相萃取儀采用哪種上樣方式最適合?
　　目前市面上常用正壓上樣和負壓上樣兩種方式萃取，但負壓上樣因不能有效控制流速而造成回收率不穩定和儀器重復性差等原因，所以主流廠家一般采用正壓上樣方式，全自動固相萃取儀采用高精度注射泵正壓上樣洗脫樣品，更加精確地控制液體流速，從而顯著提高了儀器重復性并確保了樣品回收率。
　　二、全自動固相萃取樣品處理速度有什么要求?
　　單個樣品的固相萃取循環一般為20分鐘左右，一般廠家的固相萃取儀都差不多。所以，一般來說，儀器同步處理的樣品數越多，處理速度就越快。全自動固相萃取采用6通道+3種模式靈活萃取，最大程度提高了樣品處理速度。
　　三、全自動固相萃取儀能否有效避免萃取過程中流路的堵塞?
　　自動固相萃取儀應用過程中常遇到的問題：流路堵塞造成儀器故障。
　　在發生柱堵塞時，大部分固相萃取儀不能自動檢測，使樣品和溶劑泄露，造成嚴重損失和交叉污染。全自動固相萃取儀流路內置高靈敏壓力傳感器，當流路壓力>0.6Mpa時，系統會自動報警，從而有效保護裝置。
　　四、全自動固相萃取儀能否對交叉污染進行有效控制?

　　某些自動固相萃取儀，樣品和溶劑使用同一管路，易造成污染，尤其是無清洗功能的儀器，短時間內，管路就會殘留多種化合物，這是造成很多實驗失敗的根本原因。全自動固相萃取儀采用流路分離單元自動選擇溶劑，有機溶劑廢液有獨立的廢液通道，有效避免交叉污染。